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双链DNBSEQ黑科技,还原最真实的全基因组甲基化

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DNA甲基化是重要的表观遗传学标记信息,获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据,对于表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。如何更快、更高效地获取全基因组水平上准确的甲基化信息,也一直是表观科研用户的持续关注点。

针对这些需求,华大自主研发了双链DNBSEQTM,以多快好省的方式获取全基因组水平的甲基化信息。


文末有(促销)惊喜!


01、GC偏向性小,基因组覆盖度均一性高,还原最真实的甲基化水平

甲基化多发生在基因组上高CG富集区域(例如CpG岛等),如果文库有明显的GC偏向性(文库建库片段多为高CG区域),会导致测序结果的甲基化率非常不准确/偏高。而华大双链环化的方式,可以降低桥式PCR指数型扩增的错误累计以及单链扩增结构不稳定造成的GC偏向,特别是在高GC富集区,帮助我们提高测序数据覆盖均一性,还原最真实的全基因组甲基化水平

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图1 华大BGISEQ平台文库GC偏向明显小于其他公司测序平台,特别是在高GC富集区,甲基化率更真实

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图2 华大BGISEQ平台文库gDNA正负链比例更接近1,整体基因组覆盖均一性更好

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图3 华大BGISEQ平台数据可靠,测序有效深度高,基因组覆盖度更平均


02、测序质量更高,基因组比对率显著提升5%

华大双链环化DNB测序技术使用的是非桥式PCR扩增测序方式(桥式PCR:指数型扩增,PCR错误容易被累计),提高DNA的保真性,测序质量更高,基因组比对率显著提升。

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图4 华大BGISEQ平台基因组比对率显著提升约5%,测序质量更好,有效测序数据量更多


03、有效数据多,duplicates降低超过10%

华大自主研发BGISEQ平台duplicates(测序得到了两对或两对以上的pair end reads同时比对到参考序列上相同的起始和结束位置)比率低,和常规方法相比,显著降低超过10个百分点,同样的测序量,多10%的有效数据。

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图5 华大BGISEQ平台Dup rate显著降低超10%,更高效的数据使用率


黑科技带给我们的不仅仅是技术上的优化和领先,同样带来了成本上的降低:

Duplicate 比例低10%,基因组比对率高5%,同样的测序数据量,多15%的高质量可利用数据。等于整体成本降低15%,测的越多,省的越多。

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搭配促销活动,现华大自主平台WGBS周期缩短至常规项目35工作日完整交付,大样品项目更有专门生产通道还等什么?联系我们,开启表观研究新方法,一起还原最真实的甲基化!


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