以植物为研究对象，研究不同物种、不同基因类型或不同生态类型的植物在不同生长时期或受某种刺激前后的小分子代谢产物。基于液质联用技术（LC-MS），无偏向性、尽可能多地检测植物样本内所有的小分子代谢物，对实验组和对照组进行对比分析，通过统计分析筛选差异代谢物，对差异代谢物进行代谢通路分析，进而寻找代谢物与生理病理变化的相对关系。
表1 华大高分辨植物代谢数据库（BGI HRAM-PMDB 1.0）
技术优势
1. 高质量自建库
所有代谢物均通过标准品建库，均包含一级质谱、二级质谱和保留时间信息
2. 代谢物鉴定准确度高
60种标准品校正保留时间，100% 比对标准品鉴定，鉴定数可达1,500+
3. 规范化平台严格质控
全流程标准操作程序（SOP）指导，同位素内标与QC双重质控
4. 超高分辨率质谱平台
使用Orbitrap系列谱仪进行检测，仪器分辨率高、质量精度高、稳定性好
5.分析创新
创新性引入相关性差异分析，通过多维信息整合，稳健算法直击核心功能，精准锁定关键机制。
产品应用
1. 植物生长发育研究
2. 农作物品质性状与育种改良研究
3. 植物生物和非生物逆境互作研究
4. 果蔬花卉营养和色泽代谢研究
5. 药用植物功能与活性成分研究
6. 基因功能解析与代谢通路研究
技术路线
技术参数
1. 仪器平台
LC-MS/MS：液相-Waters ACQUITY UPLC，质谱-Thermo Q Exactive / Q Exactive HF / Q Exactive HF-X
2. 分析软件
Compound Discoverer（Thermo, USA），metaX (华大自主开发的代谢组学分析软件包)
3. 数据库
华大高分辨植物代谢组数据库( BGI HRAM-PMDB)，包含保留时间、一级质谱和二级质谱信息，化合物数量2,500+
mzCloud 在线标准品数据库，包含一级质谱和二级质谱信息，化合物数量30,000+
项目周期
30-60个自然日
