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DNBelab C系列高通量单细胞RNA-seq

产品简介

DNBelab C系列平台基于液滴微流控策略,可以实现高效细胞捕获,完成高效的mRNA反转录和扩增后,结合华大DNBSEQ™高通量测序平台和Dr. Tom单细胞全交互式数据挖掘交付系统,进行高性价比单细胞转录组文库测序和数据分析挖掘,可广泛应用于研究免疫细胞、肿瘤微环境、神经系统发育及胚胎发育和干细胞分化等。

仪器1

图1 DNBelab C- TaiM4

 

产品优势

1. 稀有细胞高效捕:高效捕获稀有类型细胞,实现新突破;

2. 多种样本无挑剔:除常规活细胞悬液外,珍稀液氮速冻样本可实现细胞核水平研究;

3. 测序数据高保真:搭配DNBSEQ™测序系统,不怕单个细胞数据弄混;

4. 自主分析不求人:Dr. Tom交互式单细胞数据挖掘系统支持;

5. 服务模式一站达:流式分选服务助力目的细胞分选,一站式实现从组织到细胞数据获取及细胞群验证。
 

产品性能

  • 高灵敏度细胞分选:高效捕获稀有细胞类型

将两种不同状态的人多功能干细胞(PPSCs以及NPSCs)以99:1的比例混合后,进行DNBelab C系列平台单细胞RNA文库制备和测序,最后鉴定到NPSCs细胞比例为1.3%,表明该平台具备可靠的罕见细胞捕获能力。

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图2 各类细胞分选检出比例

 

  • 样本无挑剔:除常规单细胞悬液样本之外,珍稀液氮速冻样本可实现细胞核水平研究

采用液氮速冻的肺组织样本,提取细胞核,进行DNBelab C系列平台单细胞分选建库及测序,共获得12,822个细胞核,每个细胞核检测基因数中位数1,000以上,助力珍稀样本实现单细胞(核)水平研究。

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图3 液氮速冻肺组织样本提取细胞核分选结果展示

 

  • 有效细胞分群:与相同类型样本在其他平台已发表分群结果重合度高

DNBelab C 系列平台对人外周血 PBMC 样本进行高效细胞分选和转录组建库测序,所得单细胞数据 UMAP 降维分群后,与 2020 年 Nature Biotechnology 已发表文章中人 PBMC 细胞分类及注释结果均一致[1]。

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图4 DNBelab C系列平台的细胞分群对比

 

  • 发表多篇高分成果

截止2025年7月,DNBelab C系列单细胞平台累计发表230+篇SCI文章,包含4篇Nature,7篇Cell,1篇Science,平均影响因子12+,其中IF>10文章数有100+篇。
 

实验流程

官网图10

图5 DNBelab C系列平台单细胞技术实验全流程
 

产品类型

标准通量——预计产出5,000-10,000个单细胞/样本

*以上版本均包含建库、测序和Dr. Tom标准分析
 

测序策略

推荐DNBSEQ™平台测序:

测序策略:PE100

测序深度:推荐平均50k reads/cell

 

生信分析内容

  • 分析内容

图6 信息分析思路图
 

  • 分析交付-采用Dr. Tom 系统

            https://biosys.bgi.com/#/report/login

 

参考文献:

[1] Ding Jiarui,Adiconis Xian,Simmons Sean K et al. Systematic comparison of single-cell and single-nucleus RNA-sequencing methods.[J] .Nat Biotechnol, 2020, 38: 737-746.

 

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