产品服务

        2004 年，Paul 和 Philip 首次提出“宏蛋白质组学”概念。一般而言，宏蛋白质组学依据宏基因组数据，通过质谱技术采集特定环境条件下微生物种群中全体蛋白质信息，探索微生物组成以及代谢方式，揭示微生物与环境之间的相互关系。宏蛋白质组可以提供功能信息，反映活性菌群真实功能，揭示微生物功能以及材料与微生物群落之间的相互作用。

        根据样本来源，主要为宿主样本、环境样本，以及部分工业样本。宿主样本来源包括医学和农学方向，医学方向主要是与人体健康相关的共生微生物，包括肠道微生物（与肥胖、高血压、糖尿病等复杂疾病相关）、呼吸道微生物、生殖道微生物、甚至含量较低的皮肤微生物。农学方向主要来源与植物生产相关的菌根微生物等。环境样本的来源更加广泛，包括土壤、水体、空气和特殊环境等。工业样本包括发酵液、酒曲等。

产品优势

• 项目经验丰富，执行样本数包括：水体，藻类，大曲，酒醅，粪便，发酵液，土壤等；
• 技术权威有保证，参与全球实验室质评和 DIA 标准共建，参与人类蛋白组计划；
• 华大质谱平台参与人类蛋白质组计划（Human Proteome Project，HPP），负责第 20 号染色体的蛋白质组工作；
• 自主/参与发表多篇宏蛋白领域文章。

       1.Metabolic tuning of a stable microbial community in the surface oligotrophic Indian Ocean revealed by integrated meta-omics

        2.Metaproteomics reveals nutrient availability shaping distinct microbial community and metabolic niche in the nutrient-depleted and replete layers of an oligotrophic euphotic zone

        3.Elucidating colony bloom formation mechanism of a harmful alga Phaeocystis globosa (Prymnesiophyceae) using metaproteomics

        4. Comparative metaproteomics reveals functional differences in the blooming phytoplankton Heterosigma akashiwo and Prorocentrum donghaiense

产品应用

• 疾病诊断和治疗
• 药物研发
• 食品安全检测
• 农业生产
• 生态环境监测

技术路线

        根据研究目的对样本进行采集，提取可以获取用于后续宏蛋白检测的蛋白质样本；然后将蛋白酶解成肽段；随后采用DIA 蛋白质组定量进行质谱检测，最后对检测数据进行物种分类和功能注释等分析。

图1 技术流程

图2 信息分析流程