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空间蛋白质组学

        细胞异质性(heterogeneity)是一个普遍存在的生物学现象,即使看起来相同的细胞,也可能存在显著异质性。同时细胞间对应的空间背景信息,对于充分了解细胞功能、细胞间相互作用以及细胞异质性也是至关重要的。常规研究从整个组织或数百万细胞入手,得到的是一群细胞中信号的平均值,且缺少细胞的空间信息,难以满足对生命功能深入探究的需要。空间蛋白质组可以精细获得组织内不同细胞和功能区域的蛋白表达谱,通过将空间与细胞类型信息与蛋白质组数据联系起来,从而深入了解组织空间微环境并发现更精准的生物标志物和新的功能机制。

        目前空间蛋白质组的研究手段包括基于抗体识别的多路组织成像技术、基于手术刀解剖的区域分辨率蛋白质组学和基于激光显微切割(LCM)的空间蛋白质组学。基于 LCM 的空间蛋白质组学技术表现为较好的空间分辨率和蛋白覆盖度,通过高精度 LCM 切取感兴趣的组织区域或细胞,经过超微量样本无损提取并酶切蛋白为肽段,进而使用高灵敏度质谱,对不同空间位置的不同细胞类型的蛋白质表达进行差异分析。

 

产品优势

 

  • 蛋白鉴定深度高,0.05 mm2×10 μm 样本鉴定数达 3,000+,0.01 mm2×10 μm 样本鉴定数达 1,600+,0.002 mm2 ×10μm鉴定数 1,000 左右;

 

  • 蛋白定量稳定性高,基于 timsTOF Pro 的 4D 蛋白质组分析,对微量样本实现高精度、高深度、高稳定性蛋白质组分析;
  • 蛋白定量准确性高,四张连续切片的四个重复之间相关性达到 0.99;
  • 组织样本到数据全流程服务;
  • 蛋白组信息可对应空间信息,有全扫能力;
  • 有领域专业文章背书;
  • 华大整体在时空领域的优势,时空转录组、时空蛋白转录组、空间代谢组等,覆盖全流程空间组学。

 

产品应用

 

  • 肿瘤微环境异质性研究
  • 空间蛋白组图谱研究
  • 疾病生物标志物研究

 


 

技术路线

        使用高分辨率的质谱仪对目标样品进行分析,根据一级质谱相关的肽段峰强度、峰面积、液相色谱保留时间等信息进行定量分析。进而筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白。

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信息分析流程

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