产品介绍
细菌基因组de novo是对细菌基因组测序后从头组装。步骤为先将细菌的染色DNA机械地随机切割成一定相对分子质量范围的片段，根据不同的测序策略，构建对应大小文库，然后进行大规模测序。最终的组装水平根据研究的需要和细菌本身的特点而定，其中最高的指标是一条contig，即基因组的完整序列。
在组装的基础上，进行基因组组分分析，功能注释等分析，推测ORF是否为真实蛋白编码序列，检查功能位点，分析共有序列或特征序列、单个基因或基因间相互作用、表达调控等功能，细菌de novo测序已取代传统方法成为研究细菌进化遗传机制，关键功能基因的重要工具。可以预测重要基因和蛋白以了解其功能和可能机制；在研究病原菌的致病性与疾病的预防和治疗方面，可以鉴定致病相关基因、开发和研究疫苗、开发新型抗生素等；在研究细菌进化方面，可以研究种内进化关系。
产品优势
平台多样：多平台联合应用打造“极致完成图”
交付快速：有完善的分析流程，一键式交付，周期短
附加值高：结题报告文章化，深入挖掘基因组信息
经验丰富：已完成上万个细菌de novo项目，发表细菌基因组文章170多篇。
个性化分析：依据客户需求制定个性化信息分析方案
测序策略
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| 小片段文库 | PacBio / Nanopore文库 |
| 细菌de novo | 初级组装 | 1 Gb | - |
| 完成图 | 1 Gb | 1 Gb |
信息分析内容
信息分析条款 | 信息分析内容 |
基因组组分分析 |
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基因功能分析 |
1. III型分泌系统效应蛋白预测（革兰氏阴性菌）
1. III型分泌系统效应蛋白预测（革兰氏阴性菌） |
比较基因组分析（需要参考序列） |
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定制化分析 |
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