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真菌de novo测序

产品介绍

       真菌的基因组通常较大且复杂,传统的技术无法满足真菌全基因研究的大数据量需求,目前采用短读长、长读长测序联合组装的策略可实现真菌高级组装,某些项目可组装到接近完成图水平,为真菌的研究提供强有力的支撑,可用于预测真菌的重要基因和蛋白以了解其功能和可能机制;在研究植物致病性真菌方面,可以鉴定致病真菌与农作物互作及致病的相关基因,并可用于研究与其近缘物种的进化关系,比较基因组研究等;在食用真菌和药用真菌的研究方面,可以用于发现真菌复杂的代谢途径,鉴定其对人有益的代谢产物,及物种进化关系的研究,比较基因组等;另外还可用于生物防治真菌的研究,工业酵母菌的研究等。

 

 

产品优势

经验丰富:已完成数千个真菌de novo项目,发表真菌基因组文章50多篇。

优质服务:基于丰富的项目经验,针对客户需求提供最优的解决方案

 

研究方法

测序策略

 

 

小片段文库

PacBio / Nanopore文库

真菌de novo

初级组装

50-100X

-

高级组装

50-100X

100-200X

 

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