产品简介
全基因组甲基化Bisulfite测序是DNA甲基化研究的黄金标准，它通过Bisulfite处理和全基因组DNA测序结合的方式，对整个基因组上的甲基化情况进行分析，具有单碱基的分辨率，可精确评估单个C碱基的甲基化水平，覆盖范围广。它可以构建精细甲基化图谱，建立表观遗传学研究数据库，为后续大规模开展不同样品间的甲基化差异分析提供参考图谱。
技术优势
技术稳定性、重复性好：从样本检测到文库构建、上机测序，每一步均有严格的标准操作SOP和对应的质控标准，保证每一个样本都得到真实的测序结果。
Bisulfite转化率高：经过不断优化建库方案，华大的甲基化建库BS平均转化率高达99%以上，作为文库构建的质控指标进行严格控制。
单碱基分辨率：精确分析每一个C碱基的甲基化状态。
准确性和可靠性高：准确区分甲基化的C和未甲基化的C。
检测范围广：覆盖全基因组范围内的所有位点。
无偏向性：反映真实的甲基化状态。
经验丰富：执行了上千个项目，数万个样本，合作发表文章一百多篇。
表1 标准信息分析内容
信息分析条款 | 信息分析内容 |
标准信息分析 | 1. 数据基本处理与质控； 2. 比对结果统计； 3. 甲基位点统计与分析： 3.1. 甲基化位点鉴定； 3.2. 甲基化位点类型统计； 3.3. C位点甲基化水平分析（全基因组，染色体，功能元件）； 3.4. 甲基化位点序列特征Motif图； 3.5. 甲基化水平IGV可视化文件（.bw）； 3.6. 全基因组甲基化水平分布（样本/分组）； 3.7. 基因基因上下游甲基化水平分布（样本/分组）； 3.8. 样本相关性和PCA分析； 4. 差异甲基化分析： 4.1. 差异甲基化位点（DMC）鉴定； 4.2. DMC相关基因GO和 KEGG富集分析； 4.3. DMC锚定Promoter区域相关基因GO和KEGG富集分析； 4.4. 差异甲基化区域（DMR）鉴定； 4.5. DMR相关基因GO和KEGG富集分析； 4.6. DMR锚定Promoter区域相关基因GO和 KEGG富集分析。 |
Dr. Tom标准分析 | 1. 数据基本处理与质控; 2. 全基因组甲基化水平分析; 3. 基因附近的甲基化水平分布; 4. TE附近的甲基化水平分布; 5. 各染色体的平均甲基化水平; 6. 基因组不同转录元件中的DNA平均甲基化水平; 7. mCG、mCHG和mCHH的甲基化胞嘧啶统计; 8. 差异甲基化DMR的检测; 9. DMR相关基因的GO和Pathway分析; |
定制化信息分析 | 可结合客户的需求，协商确定定制化信息分析内容 |
