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产品服务

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全长转录组

产品简介       

 

       全长转录组产品,通过长读长测序,无需打断和拼接,直接获取包含 5’UTR,3’UTR 及PolyA 尾的完整转录本,能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的转录本序列及结构信息。可用于补充已注释基因组的基因注释结果、发现新的基因和转录本、鉴定可变剪接、基因融合现象、选择性多聚腺苷化位点等,同时改善基因/转录本表达定量结果,全面解析转录本的复杂性和多样性。

       华大科技开发了独特的多倍通量全长转录组产品以及Poly(A)全长转录组产品,提供基因转录本结构、定量,从结果到调控机制的全方位转录调控研究方案。

产品应用

       全长转录组基于PacBio单分子实时测序技术,可以直接得到全长转录本信息,无需组装,更大限度保证转录组测序结果的准确性。

       对于无参考序列的物种,全长转录组测序可以构建高质量的基因集,辅助基因注释,为后续物种的功能研究奠定基础。

       对于有参考序列的物种,可发现新的转录本,完善参考基因集;并鉴定可变剪接、基因融合等结构变异。

 

图5

 

产品优势

 

多倍通量专利技术

利用华大多倍通量全长转录组专利优势技术,将多条序列随机首尾相连,充分利用长读长测序平台优势。

充分利用读长,超高性价比

相同数据量可以获得3-6倍的有效reads,检测转录本数量翻倍。

Poly(A)+全长转录组,测一得二

同时得到全长mRNA序列以及全长Poly(A) 序列,一举两得。

Poly(A)长度和碱基检测结果准确度高

基于PacBio平台CCS测序,可直接测序得到全长的 Poly(A) 长度和碱基信息,准确度高。

技术稳定,项目经验丰富

累计执行1500+例样本,涵盖了包括植物、昆虫、哺乳动物、禽类、软体动物和水产生物在内的 240+个物种。

直接获取全长转录本

直接获得5’-3’的全长lsoform,无需拼接,所测即所得,Q32-Q36,准确性高。

UMI技术实现精准定量

利用UMI技术和多倍通量完美结合,基因定量结果更准确。

高准确结构分析

提供高精度的ORF预测,可变剪接、融合基因分析。

 

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