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长链非编码RNA测序

产品简介

lncRNA高通量测序,采用去核糖体链特异性建库方法,对长链非编码RNA、mRNA 、环状RNA等大RNA进行测序研究,从而快速全面准确地获得与特定生物学过程(例如发育、疾病等)所有大RNA转录本数据信息,可应用于细胞分化和发育的研究、调控机理的研究、疾病标志物的寻找、疾病的分子诊断、基因药物的研发等。       

                                                                                                                      


 

产品优势

1. 超高的技术稳定性

同一样本重复建库相关性Pearson值大于0.993;

2. 丰富的项目经验

已完成万例lncRNA项目,涉及人鼠及动植物物种;

3. 精湛的技术工艺

可承接人、鼠、动植物样品,外泌体、FFPE等,样品起始量低至10 ng;

4. Dr.Tom多组学数据挖掘系统交付,分析无忧

一次测序即可获得mRNA、lncRNA、circRNA及关联数据分析结果;

10大数据库注释,多维度结果图片展示,数据图表循环挖掘;

ceRNA、蛋白、共表达、关键驱动基因互作网络分析可视化;

系统随时更新文献信息,查基因得文献,便于文章撰写;

5. 严格的质量管理

实验全程采用全方位质控体系,应用质量管理体系金标准;

6. 贴心的售后支持

7*24小时全天候技术支持,快速响应客户需求。

 

产品应用 

1. 细胞分化和发育调控机理的研究

2. 疾病标志物的寻找

3. 疾病的分子诊断

4. 基因药物的研发

 

信息分析内容

标准信息分析(circRNA仅限人、小鼠)

1、基本数据统计

① 去除接头序列、低质量序列得到reads信息

② 样品相关性

③ 表达量分布

④ RNA分类

2、参考基因组比对

3、lncRNA、mRNA、circRNA鉴定

4、lncRNA、mRNA、circRNA定量分析

5、lncRNA、mRNA、circRNA差异表达分析(样本间、组间)

6、lncRNA、mRNA、circRNA表达/差异基因聚类

7、mRNA差异基因GO分类、富集

8、mRNA差异基因KEGG分类、富集

9、mRNA结构分析

① 可变剪切分析

② 融合基因分析(仅限人)

 

高级信息分析

一、数据库注释

1、转录因子注释(AnimalTFDB/PlantTFDB)

2、GSEA分析

3、Rfam、Pfam、Reactome、COG、EggNOG和InterPro数据库注释

二、互作网络分析

1、  靶基因分析

① miRNA-mRNA靶向关系分析

② lncRNA-mRNA靶向关系分析

2、  蛋白互作网络分析

3、  共表达互作网络分析

三、特色分析

1、外部数据库关联分析(TCGA、ARCHS4)

2、关键驱动基因网络图分析

3、时间序列分析

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