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TMT蛋白质组学

       定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量。可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白,结合生物信息学揭示细胞生理病理功能,同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。

       TMT(Tandem Mass Tag)串联质谱标记技术是由Thermo公司研发的一种体外同重同位素标记的相对与绝对定量技术。蛋白定量TMT技术利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团,包括4plex、8plex、16plex等不同数量标签的产品,经高精度质谱仪串联分析,最新推出的TMTpro 18plex可同时比较多达18个样品之间的蛋白组表达量差异,是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。

标记定量1 

图1 TMT试剂结构 


 

产品优势

  • 通量高:可同时对2-18种以内实验样本进行蛋白组定量分析和比较;
  • 周期短:标记混合上样大幅度压缩机时,缩短项目周期;
  • 重复性高:采用多个标记样本同时上机的方法,避免样本分别上机检测和传统制胶实验重复性差的问题;
  • 经验丰富:10余年丰富项目经验,40+项质控保障,200+篇质谱文章发表;
  • 云平台交付:采用Dr. Tom云平台进行数据交付,便于开展零生信基础的数据挖掘,以及同转录组的自主关联分析;
  • 一站式、多组学服务:提供经典的蛋白质组非靶向发现+靶向验证一站式服务;以及蛋白质组+转录组、蛋白质组+代谢组、常规蛋白质组+磷酸化蛋白质组学等一系列多组学关联分析服务。


 

产品应用

  •  人类疾病研究:

        疾病生物标志物筛选和验证

        疾病发生发展过程中的蛋白表达调控机制

        药效评估

  • 动植物基础研究:

        重要农作物农艺性及其改良措施

        动植物生长发育机制研究

        抗逆抗病机制研究

  • 微生物领域研究:

        致病机理研究

        耐药性研究

        宿主-微生物的相互作用机制研究

 

技术路线

 

信息分析

信息分析条款

信息分析条款

标准信息分析

1 标准信息分析内容

1.1 数据产出统计

1.2 蛋白质鉴定结果

1.3 蛋白质定量结果

1.4 蛋白质GO分析

1.5 蛋白质KOG/COG/eggNOG分析

1.6 蛋白质Pathway代谢通路分析

1.7 差异蛋白的GO富集分析

1.8 差异蛋白的Pathway富集分析

1.9 差异蛋白KOG/COG/eggNOG富集分析

1.10 重复性分析(仅针对设计了重复的实验)

1.11多样品间表达模式聚类(三个或三个以上样品可提供)

1.12 差异表达蛋白互作分析

1.13 差异表达蛋白亚细胞定位

1.14 蛋白信号调控分析(针对人和小鼠)

配体-受体调控分析,激酶-底物调控分析,转录因子-靶蛋白调控,蛋白信号调控分析

 

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