DIA 蛋白定量分析,主要采用数据非依赖性采集模式(data independent acquisition,DIA),通过液质联用技术(LC-MS/MS)对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,结合传统的数据依赖性采集模式(data dependent acquisition,DDA)构建的谱图库,可对蛋白质组进行鉴定、定量,获得肽段、蛋白及所属物种来源、蛋白表达量变化等信息。
蛋白定量 DIA 目前主要在三种质谱仪器平台进行检测,常规 orbitrap 类仪器,timsTOF 类仪器以及更高分辨率的 orbitrap Astral 仪器等。
产品优势
产品应用
癌症研究:肿瘤组织个体差异大背景差异大,需要单个样本采样比较
个体医疗:大规模的数据采集,需要高稳定性和重现性的技术支撑
环境适应性研究:多种环境不同水平的处理同时比较,需要高稳定性和重现性的技术支撑
模式生物机理研究:深入探究体内调控机理,实现不同组别差异蛋白比较
技术路线
信息分析条款 | 信息分析内容 |
标准信息分析 | 1 标准信息分析内容 1.1 数据产出统计 1.2 数据质控(组内变异系数、主成分分析以及样本定量相关性) 1.3 蛋白质鉴定和定量结果 1.4 蛋白质GO分析 1.5 蛋白质COG/KOG/eggNOG分析 1.6 蛋白质Pathway代谢通路分析 1.7 差异蛋白的GO富集分析 1.8 差异蛋白COG/KOG/eggNOG富集分析 1.9 差异蛋白的Pathway富集分析 1.10 重复性分析(仅针对设计了重复的实验) 1.11多样品间表达模式聚类(三个或三个以上样品可提供) 1.12 时间序列分析 1.13 差异表达蛋白互作分析 1.14 差异表达蛋白亚细胞定位 1.15 蛋白信号调控分析(针对人和小鼠) 配体-受体调控分析,激酶-底物调控分析,转录因子-靶蛋白调控,蛋白信号调控分析 |