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DIA蛋白质组学

DIA 蛋白定量分析,主要采用数据非依赖性采集模式(data independent acquisition,DIA),通过液质联用技术(LC-MS/MS)对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,结合传统的数据依赖性采集模式(data dependent acquisition,DDA)构建的谱图库,可对蛋白质组进行鉴定、定量,获得肽段、蛋白及所属物种来源、蛋白表达量变化等信息。

蛋白定量 DIA 目前主要在三种质谱仪器平台进行检测,常规 orbitrap 类仪器,timsTOF 类仪器以及更高分辨率的 orbitrap Astral 仪器等。

 

 产品优势

  • 国内唯一参与DIA测评及建立大队列DIA标准的企业,华大具有高水平的DIA技术交付能力,从鉴定数、重现性、线性、动态范围等方面看,已达到全球先进水平;具有极佳的软硬件优势和过硬的操作流程;
  • 重复性、稳定性高达90%,是大队列血液样品蛋白质组研究首选技术;
  • 针对富含临床信息的FFPE样品,提供低至1片的蛋白质组定量服务;
  • 颠覆传统,创新性引入相关性差异分析,通过多维信息整合,稳健算法直击核心功能,精准锁定关键机制;
  • 采用Dr. Tom云平台进行数据交付,便于开展零生信基础的数据挖掘,以及同转录组的自主关联分析;
  • 提供经典的蛋白质组非靶向发现+靶向验证一站式服务;以及蛋白质组+转录组、蛋白质组+代谢组、常规蛋白质组+磷酸化蛋白质组学等一系列多组学关联分析服务;
  • 提供配体-受体、激酶-底物及转录因子-靶蛋白等全方位分析,深入探索信号调控通路,更好地开展分子机制、生物标志物、疾病机理和药物开发研究(人、小鼠)。
     

产品应用

  • 精准医疗领域

       癌症研究:肿瘤组织个体差异大背景差异大,需要单个样本采样比较

       个体医疗:大规模的数据采集,需要高稳定性和重现性的技术支撑

  • 动植物微生物研究领域

       环境适应性研究:多种环境不同水平的处理同时比较,需要高稳定性和重现性的技术支撑

       模式生物机理研究:深入探究体内调控机理,实现不同组别差异蛋白比较
 

技术路线
 

【蛋白组】国内官网更新 20250430128

信息分析条款

信息分析内容

标准信息分析

1 标准信息分析内容

1.1 数据产出统计

1.2 数据质控(组内变异系数、主成分分析以及样本定量相关性)

1.3 蛋白质鉴定和定量结果

1.4 蛋白质GO分析

1.5 蛋白质COG/KOG/eggNOG分析

1.6 蛋白质Pathway代谢通路分析

1.7 差异蛋白的GO富集分析

1.8 差异蛋白COG/KOG/eggNOG富集分析

1.9 差异蛋白的Pathway富集分析

1.10 重复性分析(仅针对设计了重复的实验)

1.11多样品间表达模式聚类(三个或三个以上样品可提供)

1.12 时间序列分析

1.13 差异表达蛋白互作分析

1.14 差异表达蛋白亚细胞定位

1.15 蛋白信号调控分析(针对人和小鼠)

配体-受体调控分析,激酶-底物调控分析,转录因子-靶蛋白调控,蛋白信号调控分析

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