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PRM蛋白质组学

PRM作为靶向蛋白质组研究策略,可以有目标地检测分析特定的关键蛋白质在多样本中的含量变化情况的高通量检测技术产品。PRM技术借助Q-Orbitrap为代表的四极杆-高分辨质谱平台进行数据采集,在四级杆(Q1)选出的目标肽段离子,进入碰撞室中打碎,所有的碎片离子经过质量分析器产生一张高分辨的二级质谱图,通过提取其中的碎片离子信息即可实现目标肽段的定量。

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图1 目标蛋白MRM/PRM技术原理介绍

 

产品优势

  • 通量高:一次上机检测,可同时得到几十甚至上百种目标蛋白的定量信息
  • 周期短:无需抗体制备和Western Blotting实验过程,极大缩短了项目周期 
  • 准确性高:通过对目标蛋白母子离子对或母离子的选择,去除干扰离子,靶向精确定量
  • 特异性高:避免抗体制备过程中引入的非特异性结合因素,高效筛选目标蛋白。

 

产品应用

  • 大范围蛋白质组检测后的目标蛋白验证
  • 同源蛋白或突变蛋白定量研究
  • 开发临床诊断预测试剂盒 


 

技术路线

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图2 技术流程图

1、使用 Orbitrap 系列质谱仪进行 DDA(数据依赖性采集)模式采集数据,筛选出可检测的目标肽段 PRM list;

2、对靶标肽段离子进行 PRM 模式检测,获得子离子的信号;

3、通过分析软件(如 Skyline)进行特征子离子的筛选和峰面积积分,得到高分辨、高特异性的蛋白相对定量值。

 

信息分析流程

1、方法建立

1)目标蛋白总结;

2)数据质控;

3)PRM方法展示。

 

2、样本检测

 1)定量信息;

2)数据归一化;

3)目标蛋白相对定量。

 

3、定制化信息分析

可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容。

 

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