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全转录组

产品简介

全转录组高通量测序,采用去核糖体链特异性建库方法和小片段富集筛选建库方法,可实现编码RNA和非编码RNA的建库、测序、信息分析及联合分析、ceRNA等,从而快速全面准确地获得与特定生物学过程(例如发育、疾病等)所有大RNA转录本数据信息,这一项研究将调控机制研究延伸到“ 网、多层面”结合的立体模式,有助于相对全面解读生物学现象。

 

推荐方案

 

1.经济型模式-两种文库测序:lncRNA-seq+Small RNA

(1)大RNA研究:采用lncRNA-seq测序模式,即采用去核糖体链特异性建库模式,进行PE100测序模式,10G Clean data;实现lncRNA、mRNA、circRNA鉴定和定量、以及功能分析;

(2)小RNA研究:采用富集小RNA片段建库方法,进行有方向性的SE50测序模式,20M clean reads,实现miRNA、siRNA以及piRNA鉴定和定量,以及功能分析等;

2. 大容量模式-三种文库测序:lncRNA-seq+Small RNA+CircRNA

(1)大RNA研究:采用lncRNA-seq测序模式,即采用去核糖体链特异性建库模式,进行PE100测序模式,10G Clean data;实现lncRNA、mRNA、鉴定和定量、以及功能分析;

(2)环状RNA研究:采用去除线性RNA,反向富集环状RNA建库方法,进行PE100测序模式,10G clean data,对环状RNA高深度测序,实现对低丰度的环状RNA鉴定和定量及功能分析;

(3)小RNA研究:采用富集小RNA片段建库方法,进行有方向性的SE50测序模式,20M clean reads,实现miRNA、siRNA以及piRNA鉴定和定量,以及功能分析等; 

以上两种模式,还可以实现大RNA和小RNA互作网络分析,以及内源竞争性RNA鉴定和网络分析。
 

生物分析思路图

 

全转录组流程图 

 

产品优势

 

实验严谨

建库工艺稳定,技术重复性高,可接受多种类型样本,total RNA最低起始量低至400ng;

分析全面

包含RNA互作模式,及ceRNA竞争网络分析等,从平面调控研究延伸至立体调控研究;

数据交互

采用Dr. Tom多组学数据挖掘系统,10大数据库注释,多维度结果图片展示,数据图表循环挖掘;

质控严格

实验操作及信息分析操作采用全方位及先进的质量管理体系标准。

 

产品应用

 

动植物生长发育的研究

抗逆、抗病虫害调控机理的研究

细胞分化和发育的研究

肿瘤发生发展及转移研究

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