细胞异质性（heterogeneity）是一个普遍存在的生物学现象，即使看起来相同的细胞，也可能存在显著异质性。同时细胞间对应的空间背景信息，对于充分了解细胞功能、细胞间相互作用以及细胞异质性也是至关重要的。常规研究从整个组织或数百万细胞入手，得到的是一群细胞中信号的平均值，且缺少细胞的空间信息，难以满足对生命功能深入探究的需要。空间蛋白质组可以精细获得组织内不同细胞和功能区域的蛋白表达谱，通过将空间与细胞类型信息与蛋白质组数据联系起来，从而深入了解组织空间微环境并发现更精准的生物标志物和新的功能机制。
目前空间蛋白质组的研究手段包括基于抗体识别的多路组织成像技术、基于手术刀解剖的区域分辨率蛋白质组学和基于激光显微切割（LCM）的空间蛋白质组学。基于 LCM 的空间蛋白质组学技术表现为较好的空间分辨率和蛋白覆盖度，通过高精度 LCM 切取感兴趣的组织区域或细胞，经过超微量样本无损提取并酶切蛋白为肽段，进而使用高灵敏度质谱，对不同空间位置的不同细胞类型的蛋白质表达进行差异分析。
产品优势
✅高鉴定深度：0.05 mm2x10 um样本可鉴定3,000+蛋白，0.01 mm2x10 um达1,600+，0.002 mm2x10 um约1,000。
✅高稳准定量：基于timsTOF Pro、Astral等高性能质谱，实现微量样本高精度、高深度、高稳定性分析;四张连续切片四重复间定量相关性达0.99。
✅全流程服务：从组织样本到数据交付一站式完成，蛋白信息与空间位置精准对应，并具备全扫能力。
✅权威背书：已发表3篇指定区域扫描、1篇全扫相关领域文章。
✅平台优势：依托华大时空组学整体布局，覆盖时空转录组、时空蛋白转录组、空间代谢组等，提供全流程空间组学解决方案。
发表文章
1. Proteomic Profiling of Gastric Signet Ring Cell CarcinomaTissues Reveals Characteristic Changes of the Complement Cascade Pathway. Molecular &cellular proteomics, 2021. 胃印戒细胞癌的空间蛋白质组研究
2. The Comparable Microenvironment Shared by Colorectal Adenoma and Carcinoma: An Evidence of Stromal Proteomics. Frontiers in oncology, 2022. 结直肠癌的空间蛋白质组研究
3. Routine Workflow of Spatial Proteomics on Micro-forma-lin-Fixed Paraffin-Embedded Tissues. Analytical Chemistry, 2023. 小鼠脑空间蛋白质组图谱绘制
4. Spatially resolved proteomics surveys the chemo-refractory proteins related to high-grade serous ovarian cancer. Clinical and translational medicine, 2025. 卵巢癌空间蛋白质组图谱
产品应用
技术路线
使用高分辨率的质谱仪对目标样品进行分析，根据一级质谱相关的肽段峰强度、峰面积、液相色谱保留时间等信息进行定量分析。进而筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白。
信息分析流程
带*分析仅适用于人、小鼠及大鼠；网络分析仅在比较组中各组别均包含不少于6个生物学重复时进行。
此外还提供空间区域的蛋白鉴定数分布图
