产品简介
转录组测序，对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，既可以提供定量分析，检测基因表达水平差异，又可以提供结构分析，能发现稀有转录本，精确地识别可变剪切位点、基因融合等，而且不依赖于参考基因组。
技术优势
1.链特异性文库：能检测反义链表达，比对率更高，定量更准确，注释、可变剪切和基因融合等结果更可靠
2.样品起始量低：人鼠样本起始量仅需200 ng；可微量定制化建库，低至200 pg；可单细胞定制化建库，低至单个细胞
3.高质量的自主测序平台：DNBSEQ测序技术具有滚环复制扩增带来的错误累积低和规则阵列载片带来的信号密度高等原理性优势，大幅提高了测序的准确性；而且，基于DNBSEQ测序平台的产出数据重复序列率低(Dup率低)、有效数据利用率高、标签跳跃少（Index hopping少），能有效降低“张冠李戴”的情况
4.Dr. Tom系统：无需生信分析基础，多数据库联合分析，多维度数据展示，循环挖掘数据，轻松自主做个性化分析
5.提供针对微量样本以及降解样本等多类型样本的不同建库技术方案，以满足不同的科研需求
产品应用
医学上的应用方向
农学上的应用方向
研究内容
一、无参考序列物种
标准信息分析：
1. 测序数据过滤
2. 转录组de novo组装
3. Unigene七大功能数据库注释
4. Unigene的CDS预测
5. Unigene的TF编码能力预测
6. Unigene的SSR检测
7. Unigene表达量计算
8. 时间序列分析
9. 差异表达基因检测
10. 差异表达基因聚类分析
11. 差异表达基因GO功能分析
12. 差异表达基因Pathway功能分析
13. 差异基因蛋白互作分析
14. 植物抗病基因预测（植物样本）
定制化信息分析：
1. 可结合客户的需求，协商确定定制化信息分析内容
二、有参考序列物种
标准信息分析：
1. 基本数据统计① 去除接头序列、低质量序列得到reads信息，② 样品相关性，③ 表达量分布，④ RNA分类
2. 参考基因组比对
3. mRNA鉴定
4. mRNA定量分析
5. mRNA差异表达分析（样本间、组间）
6. mRNA表达/差异基因聚类
7. mRNA差异基因GO分类、富集
8. mRNA差异基因KEGG分类、富集
9. mRNA结构分析：可变剪切分析
10. mRNA结构分析：融合基因分析
Dr.Tom信息分析：
一）数据库注释
1. 转录因子注释（AnimalTFDB/PlantTFDB）
2. GSEA分析
3. Rfam、Pfam、Reactome、COG、EggNOG和InterPro数据库注释
二）互作网络分析
1. 靶基因分析① miRNA-mRNA靶向关系分析，② lncRNA-mRNA靶向关系分析
2. ceRNA互作网络分析
3. 蛋白互作网络分析
4. 共表达互作网络分析
三）特色分析
1. 自定义标签和自有数据上传
2. 外部数据库信息（TCGA、ARCHS4）
3. 关键驱动基因网络图分析
4. 时间序列分析
（*以上分析内容为部分物种可做。）
定制化信息分析 ：
1. 可结合客户的需求，协商确定定制化信息分析内容
