logo

logo

产品服务

Sequencing services

HM400代谢组

产品介绍

HM400代谢组通过液相色谱串联质谱(LC-MS)技术对代谢物进行高通量的靶向代谢组学检测分析,可以同时检测400多个代谢物,每个代谢物均使用标准曲线进行绝对定量,同时解决了非靶向代谢组学验证难和传统靶向代谢组学检测代谢物少的问题。覆盖各类重要的代谢物和核心代谢通路,可以充分反映代谢表型,其中200多个代谢物为肠道菌群相关代谢物。

表1 HM400代谢组检测物质类别

代谢物类别

数量

代表性物质

氨基酸

84

亮氨酸、色氨酸、谷氨酰胺、γ-氨基丁酸等

中长链脂肪酸

69

月桂酸、亚麻酸、棕榈反油酸、花生四烯酸等

短链脂肪酸

7

丙酸、丁酸、己酸等

有机酸

40

乳酸、苹果酸、柠檬酸、α-酮戊二酸等

胆汁酸

75

胆酸、熊胆酸、猪胆酸、鼠胆酸、鹅去氧胆酸等

碳水化合物

26

葡萄糖、鼠李糖、果糖-6-磷酸、核糖酸等

苯环型化合物

42

苯乙酸、马尿酸、扁桃酸、高香草酸等

肉碱

15

肉碱、L-乙酰肉碱、异戊酰肉碱、亚油酸肉碱等

吲哚类化合物

15

吲哚乙酸、3-吲哚丙酸、褪黑素等

TMAO及相关代谢物

4

三甲胺、氧化三甲胺、甜菜碱等

其他

30

烟酸、肌肽、苯乳酸等


技术优势

1. 超高通量:一次性靶向检测400多个代谢物,广泛覆盖多种重要代谢物和核心代谢通路

2. 准确定量:每个代谢物均有对应的标准曲线进行绝对定量,检测结果无需再验证

3. 高灵敏度:衍生化法有效定量低浓度及难电离的代谢物,实现超高灵敏度和跨量级检测

4. 稳定性佳:标准化的工作流程结合MRM模式,满足大样本检测分析对重现性的高度要求



产品应用

1. 临床疾病研究:生物标志物、疾病机制、药物靶点等

2. 生物医药研究:药物作用机制、药效评价、药物开发等

3. 表型与生理功能研究:生理机制、分子分型、营养运动与健康等

4. 肠道菌群研究:生物标志物、生理病理机制、宿主-肠道菌群共代谢等



技术路线

d1


技术参数

1. 仪器平台

LC-MS/MS: Waters ACQUITY UPLC,SCIEX QTRAP 6500+

2. 分析软件

自主研发的代谢组学软件包metaX[1]


项目执行周期

30-60个自然日

        

参考文献

[1] Wen, Bo, et al. "metaX: a flexible and comprehensive software for processing metabolomics data." BMC bioinformatics 18.1 (2017): 183.


案例一:研究卵泡液代谢物预测胚胎质量[1]

研究背景:

目前辅助生殖技术(ART)实施过程中常面临胚胎植入前发育停滞的问题,因此迫切需要更灵敏的分子指标用于评估卵母细胞及胚胎质量,进而提升试管婴儿的成功率。

实验设计:

由于卵母细胞质量是决定胚胎质量的主要因素,研究拟通过高通量靶向代谢组结合靶向代谢组对卵母细胞卵泡液(FF)样本(N=418)代谢物进行分析,进而评估胚胎质量。根据FF受试者胚胎的质量将其分为G(Good)、F(Fair)、P(Poor)组进行研究。

主要结论:

找到了一个由14个代谢物+3个临床指标组成的指标用于评估胚胎质量(AUC=0.711),这组指标中包含了5个磷脂酰胆碱(PC),对区分G组及P组起着关键性作用。网络分析及pathway挖掘发现卵母细胞和FF 中PC的增加可能导致更多的花生四烯酸的产生,是活性氧(ROS) 的重要来源,这可能会增强卵母细胞内的氧化应激。

d2

图1 基于P组与G组数据的统计分析结果


参考文献

[1] Wang, Ju, et al. "An increase of phosphatidylcholines in follicular fluid implies attenuation of embryo quality on day 3 post-fertilization." BMC biology 19.1 (2021): 1-14.


典型结果展示

d3


1. 重复数要求

样本类型

重复次数要求

植物、微生物、细胞样本

6

动物样本

10

临床样本

30

每组样本的生物学重复次数要求如下,重复次数越多越好。


2. 送样量要求

样本类型

建议送样量/

血清、血浆

150 µL

尿液

200 µL

动物及临床组织

100 mg

粪便、肠道内容物

150 mg

细胞(需每分样本细胞数目保持一致)

107


Q1:非靶向代谢组学检测不到的代谢物,HM400代谢组可以检测到吗? 

A1:非靶向代谢组学检测不到的代谢物, HM400代谢组是可能能检测到的。HM400代谢组是靶向代谢 组学技术,检测更有针对性,灵敏度更高,对于目标代谢物、低含量代谢物的检出能力更强。


深圳华大科技(总部)

电话:400-706-6615
邮箱:info@genomics.cn

对话图标